Table 1 Characteristics of STEC identified in the present study (all STEC were ESBL-negative)
Strain | Animal-no. | Farm-no. | MLST | Â | Â | Â | Â | Â | VAG | Â | Â | Â | Â | Â | Adhesion pattern |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Â | Â | icd | mdh | stx2 | stx1 | terD | rfb O104 | fliC H4 | pAA | aggR | astA | bfpA | escV | Â |
IMT26289 | 4 | F2 | 16* | 12* | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26290 | 4 | F2 | 16 | 12 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26294 | 5 | F2 | 1 | 20 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | + | n.t. |
IMT26296 | 16 | F6 | 26 | 9 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26297 | 21 | F11 | 43 | 5 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26299 | 28 | F16 | 1 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | LA |
IMT26300 | 28 | F16 | 1 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | LA |
IMT26303 | 35 | F18 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26304 | 37 | F18 | 18 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26305 | 42 | F18 | 26 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26307 | 43 | F18 | 109 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26308 | 43 | F18 | 109 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | + | - | - | no defined pattern |
IMT26309 | 44 | F19 | 18 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26310 | 46 | F19 | 18 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26313 | 51 | F20 | 26 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26314 | 54 | F20 | 16 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26315 | 57 | F20 | new | new | + | - | - | - | - | - | - | + | - | - | LA |
IMT26316 | 60 | F20 | new | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | no adhesion detected |
IMT26317 | 66 | F22 | 16 | 12 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26318 | 68 | F22 | 8 | 8 | + | - | - | - | + | - | - | + | - | - | no defined pattern |
IMT26319 | 71 | F24 | 18 | 53 | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26320 | 73 | F25 | 18 | 9 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | DA |
IMT26321 | 73 | F25 | 16 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26322 | 74 | F26 | 1 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26324 | 74 | F26 | 8 | 8 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26325 | 74 | F26 | 18 | 9 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26326 | 75 | F34 | 16 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26327 | 75 | F34 | 16 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26329 | 75 | F34 | 16 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26330 | 75 | F30 | 16 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26331 | 77 | F28 | 103 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26332 | 80 | F10 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26334 | 80 | F10 | 45 | 11 | - | + | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26335 | 83 | F10 | 26 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26336 | 83 | F10 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26337 | 83 | F10 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26338 | 83 | F10 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26340 | 90 | F10 | 16 | 11 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26341 | 92 | F10 | 16 | 11 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26342 | 92 | F10 | 26 | 9 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26343 | 93 | F10 | 26 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26344 | 93 | F10 | 26 | 9 | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | no defined pattern |
IMT26346 | 93 | F10 | 85 | 7 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |
IMT26355 | 98 | F10 | 103 | 24 | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | n.t. |