Skip to main content

Table 3 Frequencies of EPIYA motifs in Indonesia strains

From: Helicobacter pylori virulence genes in the five largest islands of Indonesia

Type All motifs No. A motif No B motif No C or D motif No
  EPIYA 89 EPIYA 44 EPIYA 11 EPIYA 34
  EPIYT 32    EPIYT 32   
  DPIYA 1    DPIYA 1   
  DPIYT 4    DPIYT 4   
  EPVYT 1    EPVYT 1   
Total   127       
ABD-type cagA EPIYA 62 EPIYA 29 EPIYA 7 EPIYA 26
EPIYT 19    EPIYT 19   
Total   81       
ABC-type cagA EPIYA 18 EPIYA 7 EPIYA 3 EPIYA 8
EPIYT 5    EPIYT 5   
EPVYT 1    EPVYT 1   
Total   24       
ABB-type cagA EPIYA 9 EPIYA 8 EPIYA 1 EPIYA 0
EPIYT 8    EPIYT 8   
DPIYT 4    DPIYT 4   
DPIYA 1    DPIYA 1   
Total   22