From: Phylogenomics of Colombian Helicobacter pylori isolates
Populations | FsT | GammaST | ||
---|---|---|---|---|
horB | vacA | horB | vacA | |
Amerind | ||||
G vs. hspAmerind | 0.297 | 0.204 | 0.131 | 0.131 |
GA vs. hspAmerind | 0.313 | 0.186 | 0.151 | 0.116 |
IM vs. hspAmerind | 0.28 | 0.214 | 0.132 | 0.141 |
IGA vs. hspAmerind | 0.316 | 0.334 | 0.232 | 0.262 |
DGA vs. hspAmerind | 0.33 | 0.367 | 0.285 | 0.240 |
G/DU vs. hspAmerind | 0.337 | 0.112 | 0.280 | 0.133 |
IM/DU vs. hspAmerind | 0.303 | −0.062 | 0.269 | 0.110 |
Europe | ||||
G vs. HpEurope | 0.049 | 0.062 | 0.079 | 0.071 |
GA vs. HpEurope | 0.056 | 0.063 | 0.084 | 0.069 |
IM vs. HpEurope | 0.037 | 0.064 | 0.073 | 0.073 |
IGA vs. HpEurope | 0.059 | 0.119 | 0.090 | 0.109 |
DGA vs. HpEurope | 0.051 | 0.143 | 0.074 | 0.098 |
G/DU vs. HpEurope | 0.044 | 0.014 | 0.057 | 0.052 |
IM/DU vs. HpEurope | 0.082 | −0.008 | 0.050 | 0.052 |
Asia | ||||
G vs. HpAsia | 0.163 | 0.27 | 0.167 | 0.200 |
GA vs. HpAsia | 0.172 | 0.266 | 0.174 | 0.190 |
IM vs. HpAsia | 0.163 | 0.274 | 0.167 | 0.210 |
IGA vs. HpAsia | 0.158 | 0.326 | 0.163 | 0.275 |
DGA vs. HpAsia | 0.162 | 0.355 | 0.133 | 0.239 |
G/DU vs. HpAsia | 0.15 | 0.214 | 0.099 | 0.170 |
IM/DU vs. HpAsia | 0.153 | 0.121 | 0.083 | 0.131 |
Africa | ||||
G vs. HpAfrica | 0.055 | 0.016 | 0.054 | 0.083 |
GA vs. HpAfrica | 0.076 | 0.009 | 0.063 | 0.075 |
IM vs. HpAfrica | 0.077 | 0.007 | 0.063 | 0.083 |
IGA vs. HpAfrica | 0.095 | 0.059 | 0.132 | 0.148 |
DGA vs. HpAfrica | 0.013 | 0.051 | 0.133 | 0.134 |
G/DU vs. HpAfrica | 0.077 | −0.058 | 0.197 | 0.109 |
IM/DU vs. HpAfrica | 0.082 | −0.093 | 0.229 | 0.148 |