Table 2 Characteristics summary of invasive strains of fecal origin
From: High carriage of adherent invasive E. coli in wildlife and healthy individuals
Origin | Type of strains | ID | Serotype | Phylogroup | Source | Virulence genes | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
stx-1 | stx-2 | ipaC | estA | elt | tia | bfpA | eae | exhA | aggR | pCVD432 | afaD | ||||||
Humans | Invasive strains | ECOR1 | ON:HN | A | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
ECOR2 | ON:H32 | A | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR9 | ON:NM | A | Human, Sweden | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR15 | O25:NM | A | Human, Sweden | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR63 | ON:NM | B2 | Human, Sweden | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | ||
ECOR35 | O1:NM | D | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR36 | O79:H25 | D | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR43 | ON:HN | E | Human, Sweden | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
Animals | ECOR7 | O85:HN | A | Orangutan, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
ECOR23 | O86:H43 | A | Elephant, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR45 | ON:HM | B1 | Pig, Indonesia | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR67 | O4:H43 | B1 | Goat, Indonesia | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR69 | ON:NM | B1 | Celebese ape, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR70 | O78:NM | B1 | Gorilla, USA | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | ||
ECOR52 | O25:H1 | B2 | Orangutan, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR57 | ON:NM | B2 | Gorilla, USA | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR44 | ON:HN | D | Cougar, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR46 | O1:H6 | D | Celebese ape, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
Humans | Cell detaching strains | ECOR6 | ON:HM | A | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
ECOR51 | O25:HN | B2 | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | ||
ECOR53 | O4:HN | B2 | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR54 | O25:H1 | B2 | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
ECOR59 | O4:H40 | B2 | Human, USA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||