Genotyping and antibiotic resistance of thermophilic Campylobacter isolated from chicken and pig meat in Vietnam

Table 1 Presence of virulence-associated genes, lipooligosaccharide biosynthesis genes and other gene loci in Vietnamese Campylobacter isolates

Species	09CS 0040^a	09CS 0043^a	09CS 0046^a	09CS 0047^a	09CS 0049^a	09CS 0067^a	09CS 0066^b	09CS 0068^b	09CS 0051^a	References
Species	C.j	C.j	C.j	C.j	C.j	C.j	C.j	C.j	C.c	References
Virulence-associated genes
flaA	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
flaB	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
flhA	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
fliM	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
fliY	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[29]
ciaB	+	+	+	+	−	+	+	+	−	[29]
iamA	+	+	+	+	+	+	+	+	−	[29]
virB11	−	+	−	+	−	−	−	−	−	[29]
cadF	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
docA	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
docB	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
docC	−	−	−	−	+	+	+	−	−	[29]
cdtA	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
cdtB	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
cdtC	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[29]
wlaN	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[29]
cgtB	−	−	−	+	+	+	+	+	+	[29]
LOS genes
pglB	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[46]
Cje1278	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Cje1280	−	−	−	+	−	+	−	−	−	[46]
Cj1434c	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Cj1138	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Cj1438c	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Cj1440c	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Cj1136	−	−	−	−	−	−	−	−	−	[46]
Secretory genes
secD	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[77]
secF	+	+	+	+	+	+	+	+	+	[77]
Paralogous gene family
maf1	+	+	−	+	+	+	+	+	+	[78]
maf4	+	+	+	+	−	+	+	+	+	[78]
Type VI secretion system
hcp	+	+	+	+	+	+	+	+	−	[39]

ISSN: 1757-4749